La Reserva de la Biosfera Sierra Manantlán (RBSM), ubicada en Jalisco y Colima se ha logrado proteger un área de 139 mil 570 hectáreas de selvas secas, bosques y terrenos agrícolas que albergan cerca de tres mil especies de plantas vasculares y 579 de vertebrados, los cuales proporcionan importantes servicios ambientales para el suroeste de Jalisco y el noroeste de Colima.
Existen importantes proyectos para la zona , y uno de ellos es el modelo conceptual propuesto originalmente por el Programa del Hombre y la Biosfera (MAB-UNESCO), que busca integrar conservación de la naturaleza con alternativas de desarrollo local, y el establecimiento de mecanismos de gestión participativa entre la Comisión Nacional de Áreas Naturales Protegidas (Conanp), un centro de investigación científica, las comunidades agrarias, organizaciones campesinas y asociaciones civiles locales y los gobiernos estatales y municipales, entre otros.
Ademas se crearon proyectos comunitarios de aprovechamiento de recursos naturales; la Junta Intermunicipal de Medio Ambiente para la Gestión Integral de la Cuenca Baja del Río Ayuquilajira, donde se ubica 60 por ciento de la reserva, dando lugar a que 10 primeros programas municipales en Jalisco de reciclado de desechos sólidos. Se creó un mecanismo de compensación por servicios ambientales hidrológicos que vincula la conservación comunitaria de los bosques con el abastecimiento de agua para la capital del estado de Colima.
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